手術室凈化是以室內微生物為控制目標，運行參數以及分級指標，空氣潔凈度是必要的保障條件。手術室凈化按潔凈程度為分為級：

1.特別手術室凈化：手術區潔凈度為百級，周邊區為千級。適用于關節轉換、移植、腦外科、外科及心臟外科等無菌手術；

2.手術室凈化：手術區潔凈度為千級，周邊區為萬級，適用于胸外科、泌尿外科、肝膽胰外科、骨外科及取卵等無菌手術；

3.一般手術室凈化：手術區潔凈度為萬級，周邊區為十萬級，適用于普通外科、皮膚科及腹外科等手術；

4.準手術室凈化：空氣潔凈度為十萬級，適用于產科、肛腸外科等手術。

潔凈手術部用房除潔凈度級另和細菌濃度應符合相應的級別外，有關的技術參數還應符合有關規定，見潔凈手術部各級用房的主要技術參數表。

潔凈手術部的平面布局按照一般要求應分為潔凈區與非潔凈區兩部分。手術室和直接為手術室服務的功能用房應設在潔凈區內。人與物通過手術部內不同潔凈度區域時，應設氣閘、緩沖室或傳遞窗。一般將手術室設在核心部分。內部平面和通道形式應符合功能流程。