現代的手術室凈化源于16世紀的意大利和法國，在這之前的醫學史上，很少提到手術室。最早建立的永久性手術室是一個圓形劇場。但這圓形劇場不是為活著的人做手術，而是為了尸體解剖。一個世紀以前的手術并不是在固定的地方施行，而是在病房活著患者家中，也可在醫生的診所中。知道1860年，越來越多的外科手術開始在圓形劇場施行，外科手術秉承一種公開的活動。傳統手術室的一個共同特點是一個玻璃聚光燈、木質的地板和墻壁，一個小小的手術空間，周圍擠放著觀眾席的種種設施。此時手術室的價值主要在于其規模：它能容納的觀眾數量。1885年，德國醫生Neuber提出一個新的概念--感染控制，他設計并建造了第一個消毒滅菌的手術室。感染控制得到外科醫生的普遍重視，木質的劇場式的手術室被棄用，更安全的手術室套間經過一個世紀的轉變沿用至今。進入20世紀，手術室更加矚目的進步。為了預防感染，手術室的設計也有了很大的變化，主要是將干凈的物流和污染的物流分開，以防止交叉感染。到20世紀9年代，手術室建設已經趨向于空氣凈化，服裝變革。